| Datum | Paarung | Ergebnis | Bilder |
| 05.08.2006 | 1. FC Magdeburg - Hamburger SV II | 0:0 | - |
| 09.08.2006 | Holstein Kiel - 1. FC Magdeburg | 5:0 | klick |
| 12.08.2006 | 1. FC Magdeburg - Borussia Mönchengladbach II | 3:0 | - |
| 19.08.2006 | Rot-Weiß Ahlen - 1. FC Magdeburg | 2:1 | - |
| 26.08.2006 | 1. FC Magdeburg - VfL Osnabrück | 2:0 | klick |
| 02.09.2006 | Fortuna Düsseldorf - 1. FC Magdeburg | 3:1 | klick |
| 13.09.2006 | 1. FC Magdeburg - FC Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | klick |
| 16.09.2006 | Dynamo Dresden - 1. FC Magdeburg | 2:1 | - |
| - | spielfrei | - | - |
| 30.09.2006 | 1. FC Magdeburg - Wuppertaler SV | 1:0 | klick |
| 14.10.2006 | Borussia Dortmund II - 1. FC Magdeburg | 1:3 | - |
| 21.10.2006 | 1. FC Magdeburg - VfB Lübeck | 0:2 | klick |
| 28.10.2006 | Werder Bremen II - 1. FC Magdeburg | 2:2 | - |
| 04.11.2006 | 1. FC Magdeburg - Hertha BSC Berlin II | 2:0 | - |
| 08.11.2006 | 1. FC Union Berlin - 1. FC Magdeburg | 1:2 | - |
| 11.11.2006 | 1. FC Magdeburg - SV Wilhelmshaven | 3:0 | klick |
| 18.11.2006 | Bayer 04 Leverkusen II - 1. FC Magdeburg | 1:1 | - |
| 25.11.2006 | 1. FC Magdeburg - Kickers Emden | 1:1 | klick |
| 02.12.2006 | FC Sankt Pauli - 1. FC Magdeburg | 2:0 | klick |
| 09.12.2006 | Hamburger SV II - 1. FC Magdeburg | 1:1 | - |
| 10.02.2007 | 1. FC Magdeburg - Holstein Kiel | 0:0 | klick |
| 17.02.2007 | Borussia Mönchengladbach II - 1. FC Magdeburg | 1:2 | - |
| 24.02.2007 | 1. FC Magdeburg - Rot-Weiß Ahlen | 0:2 | klick |
| 03.03.2007 | VfL Osnabrück - 1. FC Magdeburg | 1:1 | - |
| 10.03.2007 | 1. FC Magdeburg - Fortuna Düsseldorf | 2:2 | klick |
| 17.03.2007 | FC Rot-Weiß Erfurt - 1. FC Magdeburg | 2:2 | - |
| 24.03.2007 | 1. FC Magdeburg - Dynamo Dresden | 1:0 | klick |
| - | spielfrei | - | - |
| 31.03.2007 | Wuppertaler SV - 1. FC Magdeburg | 1:3 | - |
| 07.04.2007 | 1. FC Magdeburg - Borussia Dortmund II | 2:2 | - |
| 14.04.2007 | VfB Lübeck - 1. FC Magdeburg | 0:1 | - |
| 21.04.2007 | 1. FC Magdeburg - Werder Bremen II | 2:0 | klick |
| 28.04.2007 | Hertha BSC Berlin II - 1. FC Magdeburg | 0:2 | - |
| 05.05.2007 | 1. FC Magdeburg - 1. FC Union Berlin | 3:1 | klick |
| 12.05.2007 | SV Wilhelmshaven - 1. FC Magdeburg | 0:2 | - |
| 19.05.2007 | 1. FC Magdeburg - Bayer 04 Leverkusen II | 1:1 | klick |
| 26.05.2007 | Kickers Emden - 1. FC Magdeburg | 4:2 | - |
| 02.06.2007 | 1. FC Magdeburg - FC Sankt Pauli | 1:1 | klick |
| Datum | Ereignis | Paarung | Ergebnis | Bilder |
| 09.09.2006 | DFB-Pokal (1. Runde) | 1. FC Magdeburg - SC Paderborn 07 | 1:1 , 6:7 i.E. | - |
| 24.09.2006 | Landespokal (2. Runde) | Grün-Weiß Wimmelburg - 1. FC Magdeburg | 2:2 , 3:4 n.V. | - |
| 03.10.2006 | Landespokal (Achtelfinale) | FC Grün-Weiß Wolfen - 1. FC Magdeburg | 1:0 | - |
| 03.10.2006 | Landespokal (Achtelfinale) | 1. FC Magdeburg II - Hallescher FC | 1:1 , 4:3 i.E. | klick |
| 19.12.2006 | Testspiel | 1. FC Magdeburg - Eintracht Braunschweig | 0:0 | klick |
| 23.01.2007 | Testspiel | 1. FC Magdeburg - SV Werder Bremen | 0:3 | klick |
| 09.04.2007 | Landespokal (Halbfinale) | 1. FC Magdeburg II - VfB Germania Halberstadt | 1:1 , 6:5 i.E. | klick |
